Formuoja valstybės politiką aplinkos apsaugos srityje, įskaitant kraštovaizdį ir biologinę įvairovę. Organizuoja, koordinuoja ir kontroliuoja šios politikos įgyvendinimą.
Tvirtina:
Invazinių rūšių valdymo ir naikinimo veiksmų planų tvirtinimo tvarkos aprašą,
Invazinių rūšių Lietuvos Respublikos teritorijoje sąrašą,
Invazinių rūšių valdymo ir naikinimo tvarkos aprašą,
Invazinių rūšių kontrolės tarybos sudėtį ir Invazinių rūšių kontrolės tarybos nuostatus.
Išduoda leidimus, stabdo jų galiojimą, panaikina galiojimą arba galiojimo sustabdymą įgyvendinant 2014 m. spalio 22 d. Europos Parlamento ir Tarybos reglamento (ES) Nr. 1143/2014 dėl invazinių svetimų rūšių introdukcijos ir plitimo prevencijos ir valdymo 8 ir 9 straipsnius,
teikia Europos Komisijai paraiškas, numatytas 2014 m. spalio 22 d. Europos Parlamento ir Tarybos reglamento (ES) Nr. 1143/2014 dėl invazinių svetimų rūšių introdukcijos ir plitimo prevencijos ir valdymo 9 straipsnyje,